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拦截骚扰电话时，是否会拦截银行电话取决于所使用的拦截系统的设置和智能程度。
一些骚扰电话拦截工具可以智能识别并非真正的骚扰电话的号码，例如误判某些正规机构的电话为骚扰电话，包括银行电话，现代的拦截工具也越来越智能，能够识别并允许一些特定的号码通过，例如紧急服务或已知的联系人号码，如果设置了合理的拦截规则，银行电话通常不会被拦截。
如果担心会误拦截重要的电话，建议将银行的电话号码添加到拦截工具的允许列表中，以确保能够接收到来自银行的电话，还可以仔细查看拦截记录，确认是否真正拦截了骚扰电话或其他不希望的来电。
正确地设置和使用拦截工具非常重要，以确保不会误拦截重要的电话同时有效地阻止骚扰电话，是否会拦截银行电话取决于具体的拦截工具设置和使用方式。